高光譜遙感技術在農業遙感監測方面應用很普遍。
以前要確定壹塊地有沒有被翻墾開種，需要現場查看才能判斷，現在利用高光譜遙感技術，就能輕易識別。
因為土壤被翻墾後，土壤的結構、水分都會改變，高光譜遙感技術就是根據這種細微的土質變化，識別出翻墾土壤與原狀土壤的變化。
現在很多地區都啟用了農情遙感監測平臺，比如飛燕遙感研發的三維智慧農保系統，通過遙感大數據采集農田、作物、氣象、災害等信息，對農田使用情況、種植結構變化、農情以及農業災害等進行監測。不僅為政府指導農業生產、制定農業政策、發放補貼及防災減災等提供決策依據；也為保險公司災前核保、災後定損理賠提供客觀依據；還為銀行農業貸款提供貸前征信數據和貸後監管。
在水汙染防治中，高光譜遙感也有很大作用。傳統黑臭水體監測主要依靠地面人工測量，耗時費力，采樣點位布置數量和監測頻率有限，而高效的遙感技術，可以為之助力。因為黑臭水體與其他正常水體在光譜特征及色度上往往存在著明顯差異。