1、公積金余額可以還商業貸款。用商業貸款買房可以用住房公積金還款，也可以將商業貸款轉為住房公積金貸款，申請人或者配偶應當在本市已辦理了，用於購買本市行政區域內的自住住房的商業性住房按揭貸款，且該貸款尚未結清。
2、法律依據：《住房公積金管理條例》第十四條
新設立的單位應當自設立之日起30日內到住房公積金管理中心辦理住房公積金繳存登記，並自登記之日起20日內持住房公積金管理中心的審核文件，到受委托銀行為本單位職工辦理住房公積金賬戶設立手續。
單位合並、分立、撤銷、解散或者破產的，應當自發生上述情況之日起30日內由原單位或者清算組織到住房公積金管理中心辦理變更登記或者註銷登記。
並自辦妥變更登記或者註銷登記之日起20日內持住房公積金管理中心的審核文件，到受委托銀行為本單位職工辦理住房公積金賬戶轉移或者封存手續。
二、公積金提取流程是什麽
1、個人向單位申請，填榷職工住房公積金提取申請表》並提交各條件下對應的支取證明材料；
2、單位審查通過後通報公積金中心，職工銷戶提取時單位還需往經辦銀行辦理相關人員公積金封存；
3、公積金中心對職工公積金提取申請進行審批；
4、公積金中心轉賬至單位，由單位轉入職工銀行賬戶。