根據《關於調整市住房公積金管理中心及其下屬管理部機構編制事項的通知》（嶽編辦[2011]153號），管理中心內設6個科室，分別為綜合科、計劃發展科、稽核監察科、貸款管理科、財務管理科和信息管理科。
⑴ 綜合科
負責組織協調機關日常工作；負責文秘、保密、檔案、後勤和接待工作；負責年度工作考核、相關工作督查和文明創建實施；負責人事、安全保衛、資產采購管理、車輛管理、勞資等工作。
科 長：王鳳鳴
副科長：彭 娜
⑵ 計劃發展科
負責編制、執行住房公積金年度歸集、支取計劃；負責指導住房公積金繳存開戶、變更、對賬、匯繳、轉移、支取、等業務工作；負責全市住房公積金的月度、年度統計、報表工作；負責開展業務培訓。
科 長：何情
副科長：張蓉
⑶ 監察稽核科
負責制定實施年、季、月度風險控制工作計劃並承擔報表分析工作；負責對貸款發放進行抽樣調查和稽查；負責對歸集賬務、支取進行監督稽查。
科 長：楊煉鍇
副科長：葉積安
⑷ 貸款管理科
負責編制和執行住房公積金年度貸款計劃；負責指導全市貸款業務工作，受理貸款投訴，負責全市貸款風險控制，檢查住房公積金個人住房抵押貸款；牽頭組織貸款本息的催收催還。
科 長：劉睿
副科長：龍慶
⑸ 財務管理科
負責編制財務預、決算執行情況的分析以及對管理部目標考核經費劃撥、費用審核。
科 長：樊盛英
副科長：彭憶武
⑹ 信息管理科
負責住房公積金管理信息系統、市中心和管理部與業務承辦銀行業務信息系統的建設實施和管理維護；負責管理維護市中心網站；負責協調住房公積金聯名卡信息工作。
科 長：陳新
副科長：於江