公積金貸款利率相對較低。
住房公積金受到很多購房者的歡迎，主要是因為其利率遠低於商業貸款。目前各地區首套房貸年利率5年以內(含5年)4%，5年以上4.5%；二套房貸5年以內(含5年)年利率4.4%，5年以上年利率4.95%。
商業貸款是在央行基準利率基礎上浮動的貸款利率。各地區銀行住房貸款幾乎沒有優惠利率。即使有優惠，利率也比住房公積金高。目前貸款期限在1年以內，年利率5.35%；1-5年年利率5.75%；5年期年利率5.90%，比較高。
商業貸款手續更簡單。
申請公積金貸款，借款人首先要向個貸部門提交貸款申請表和申請材料，需要收入證明等材料；然後個貸部門對貸款申請進行審查並實地勘察，然後報貸審會審批，再由受托銀行通知借款人開立還款準備金賬戶並與之簽訂借款合同和擔保合同，再由借款人辦理抵押物或質押權登記備案手續。這些手續完成後，個貸部撥付貸款資金，受托銀行發放貸款。手續很復雜。
商業貸款是借款人在簽訂購房合同後，直接將相關材料提供給相關銀行代理機構或與銀行簽訂合作協議的開發商，然後銀行查詢個人信用記錄，審核相關材料，符合準入條件即可辦理，省時省力。
隨著中國房地產市場的發展，房價已經超出了普通購房者的預期。如果購房者遇到合適的二手房，準備購買，毫無疑問貸款是最好的方式。但在具體貸款方式的選擇上，二手房購房者要結合自身情況和兩種貸款方式各自的優勢，努力選擇壹種合適的、經濟的貸款方式。
(以上回答發布於2015-09-25。目前的購房政策請參考實際情況。)
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