1.適用範圍不同:小企業會計制度適用於不對外籌資的小規模企業。企業會計制度的適用範圍可以適用於不籌集資金的企業、經營規模小的企業和金融保險企業。
2.會計科目不同:小企業會計制度比企業會計制度少25個壹級科目。
3.會計處理不同:小企業會計制度中沒有“待處理財產損溢”科目。但在企業會計制度的資產負債表中，已取消了待處理資產的項目，企業在編制前必須對待處理資產進行處理，所以財產清查要通過“待處理資產損失和溢余”的核算。
4.財務報告差異:小企業會計準則只要求小企業提供兩個基本報表，即資產負債表和利潤表，報表內容相對簡單。
擴展數據:
小企業會計準則的特點
(壹)《小企業會計準則》簡寫
如《小企業會計準則》第12條和第13條規定了非貨幣性交易和債務重組中資產入賬價值的確定原則，這兩類業務中的資產評估方法在今後的資產評估中不再重復，減少了系統的篇幅，更易於閱讀。
企業會計準則中，在規定每壹類非貨幣性資產的計價時，需要反復說明如何確定非貨幣性交易換出的資產和接受債務人以非現金資產清償債務所取得的資產的入賬價值，寫法不夠簡化。
(B)簡化會計方法
通過以上不同方面的比較可以看出，小企業會計準則與企業會計準則的區別主要體現在小企業會計準則規定的核算方法比企業會計準則規定的核算方法簡單。
比如合並4個壹級學科，則減少25個壹級學科；基本財務報表項目數減少9個；部分資產估值方法簡化，如融資租入的固定資產估值；簡化了相關會計事項的核算方法，如資產存貨核算、長期股權投資核算、所得稅核算、期末計提長期資產減值準備等。
但需要註意的是，小企業會計準則的簡化並不是會計方法的變化，而是仍然保持了與企業會計準則的壹致性，以便在未來小企業規模發生變化時，可以減少需要調整和說明的內容。
因為我國對小企業的劃分是根據總資產、營業額、員工人數和是否從外部籌集資金來劃分的，所以在各種經濟活動中，小企業和大中型企業沒有本質的區別。
參考資料:
百度百科-企業會計制度