辦理銀行承兌匯票的程序如下：
(1) 銀行承兌匯票具體由付款人或承兌申請人向銀行提出申請，經銀行審查同意，由承兌銀行在商業匯票上簽字承兌，保證此票到期無條件付款。銀行承兌匯票是商業信用與銀行信用相結合的信用票據，銀行承兌實質是銀行對外信用擔保的壹種形式。承兌銀行按票面金額向承兌申請人收取千分之壹的承兌手續費，承兌手續費每筆不足十元的，按十元計收。
(2) 收款單位或被背書人將要到期的銀行承兌匯票連同填制的郵劃或電劃委托收款憑證，壹並送交銀行辦理轉賬，根據銀行的收賬通知，據以編制收款憑證。收款單位將未到期的商業匯票向銀行申請貼現時，應按規定填制貼現憑證，連同匯票壹並送交銀行，根據銀行的收賬通知，據以編制收款憑證。
(4) 承兌申請人於銀行承兌匯票到期前將款項付給收款人、被背書人或貼現銀行。付款單位在收到銀行的付款通知時，據以編制付款憑證。如果承兌申請人於銀行承兌匯票到期日未能足額交存票款，承兌銀行除憑票向收款人、被背書人或貼現銀行無條件支付外，應根據承兌協議規定，將尚未折回的承兌金額轉入付款人(承兌申請人)的貸款戶，作逾期貸款處理，對承兌申請人執行扣款，並對尚未扣回的承兌金額每天按萬分之五計收罰息。
為了加強商業匯票的管理，企業應指定專人負責管理商業匯票，並設?"應收、應付票據備查簿"，對每壹筆應收、應付票據進行詳細登記，到期結清票據，在"備查簿"中逐筆予以註銷