申請公積金房貸後，借款人可以選擇自動扣款來償還月供。公積金自動扣款是指主貸款人公積金賬戶、輔助貸款人公積金賬戶、還款卡、三個賬戶中任意壹個賬戶余額大於或等於待還貸款本息時，成功扣款。只要賬戶有足夠的余額，每個月都可以自動扣除需要扣除的費用，不需要每個月都設置鬧鐘提醒還款。
2.對沖貸款償還
住房公積金按揭還款是委托銀行從個人公積金賬戶余額中提取資金用於按月或提前還貸。房貸還款可以分為“年按揭”和“月按揭”兩種方式。
(1)年還款法相當於壹年部分提前還款壹次，但這種方式優先償還公積金貸款本金，每月還款額必須用現金償還。
(2)采用按月還款方式，除公積金貸款的“每月應還本息額”外，還可以沖抵商業貸款的“每月應還本息額”。
擴展數據:
公積金還款方式有哪些？
1.提取公積金壹次性還款方式:即通過提取住房公積金余額壹次性償還貸款余額後，借款人按照剩余貸款本金和剩余還款期限重新計算的月還款額繼續按月還款。
2.提取公積金停止還款幾個月的方法:即以提取的住房公積金余額壹次性還清貸款余額後，將提取的公積金余額與當期月還款額取整後停止還款相應的月數。還款月數不超過12個月(提取用於還款的公積金余額大於12個月的，還款月數不超過12個月)。暫停後，借款人應繼續按月償還貸款。暫停期間所欠利息不計罰息或復利，暫停後從每月還款中扣除。(目前部分銀行因系統原因暫不接受該方式)。
3.公積金提取及月還款法:即每月從客戶公積金賬戶中直接提取用於償還當月貸款本息的金額的方法。提取的公積金金額不足時，委托人應當及時補足還款額。