公積金貸款限額：雖然公積金貸款買房的利率低，但是它貸款的額度有限制，這也是很多人即便繳納有住房公積金，仍舊放棄公積金選擇商業貸款的主要原因，雖然個人與夫妻申請的最高額度不同，但在壹二線城市，就算公積金貸款貸到了最高額度，也完全不夠買房。
異地貸款手續麻煩：如果大家都有異地貸款買房想法的話，壹定要了解清楚公積金是否可以辦理異地貸款買房，因為支持公積金異地貸款的城市還是極少數的。目前大部分城市僅支持省內公積金異地貸款，支持全國範圍內公積金異地貸款且沒有戶籍限制的城市還很少，支持跨省公積金異地互貸的城市更是掰著手指頭都能數的清的寥寥無幾。