就具體差異而言，可能有以下幾點:
1.績效考核指標:不同機構可根據自身職能任務設定不同的績效考核指標。市級事業單位的績效考核可能更註重市級總體目標的完成情況，如經濟發展和基礎設施建設；繁昌區事業單位的績效考核可能更註重區域內的發展和服務。
2.績效評估系統:績效評估系統可能存在差異。市政府直屬事業單位可能有統壹的考核標準和評價指標，對市內事業單位的評價可能更註重績效排名和激勵機制；但繁昌區事業單位績效評價可能更多考慮區域特點和實際情況。
3.績效獎勵制度:績效考核的結果可能會影響事業單位的獎勵制度。市政府直屬事業單位可能會有更多的激勵機制和措施，如績效工資和職位晉升；繁昌區事業單位的獎勵制度可能更註重鼓勵和榮譽。
需要註意的是，以上回答僅供參考，具體表現差異在不同地區和單位可能有所不同。最準確的答案應該基於相關法律和政策。建議咨詢相關部門或查閱相關法律法規進行深入了解。