1、兩者土地性質不同：新民居所占有土地是集體土地，而商品房所占有土地是國有土地,是開發商通過招拍掛取得國有土地使用權的。中國的土地都是國有的，商品房的商品住宅是開發商從政府手上租了七十年，交著地錢，所以房屋價格要高。而新民居是省裏直接給當地村批的項目，所占地還是屬於當地村，開發商只是屬於代建的性質，所以房屋價格要低。
2、付款方式不同：新民居由於土地的性質決定了它是不能辦理貸款的。而商品房房由於有國有土地使用證和商品房預售證，是可以到銀行辦理貸款的。因此所有的新民居目前依照各地政策，只能是壹次性全款購買，或分期交付。
3、戶口問題：新民居的房子購買後是不能落戶的，商品房的房子是可以落戶的。如果新民居能落戶口的話，也會註明不能享受當地村民的同等待遇，因為如果若幹年後要拆遷了，當地村民是有地的補償款的，如果妳的戶口落到了村裏，等於是去分地了。
4、房本問題：新民居的本由當地村或開發商開具,只是證明妳有房屋的使用權而已，不能去銀行做抵押。正規的新民居自己居住是完全沒問題。因為新民居項目是由省裏直接給當地村批的項目，不通過市裏房管局管轄，而且地還是屬於當地村，所以不會有商品房的商品房的那種房本。
5、交易問題：新民居的再次交易，可以通過開發商或村裏協商，進行購房手續的更名，不通過房管局的過戶手續。
擴展資料
商品房（shāng pǐn fáng）在中國興起於80年代，它是指經政府有關部門批準，由房地產開發經營公司（個人、外國公司）向政府機關單位租用土地使用權期限40年、50年、70年開發的房屋，建成後用於市場出售出租的房屋，包括住宅、商業用房以及其他建築物。商品房又稱“大產權房”。
壹、《國有土地使用證》，證明開發商已合法取得該土地的使用權，並已繳納土地出讓金
二、《建設工程規劃許可證》，證明該房地產項目規劃已取得規劃部門許可
三、《建設用地規劃許可證》，表明政府允許在該土地上進行項目開發建設
四、《建築工程施工許可證》，表明政府允許該項目進行施工建設
五、《商品房銷售(預售)許可證》，表明政府允許進行期房預售、現房銷售等
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