管理中心下設四個科室（辦公室、財務科、歸集管理科、信貸管理科）和五個管理部（靈山縣、浦北縣、欽南區、欽北區、欽州港區），根據住房公積金管理委員會的統壹決策，統壹負責管轄範圍內住房公積金的管理運作，實行統壹規章制度、統壹核算。
欽州住房公積金管理中心將在住房公積金管理委員會的正確決策下，在各級政府及相關部門的大力支持下，在社會各界的廣泛監督下，積極開拓，勇於創新，進壹步加強資金歸集力度，在確保資金安全的前提下，加大資金投放力度，提高住房公積金使用率，真正做到住房公積金取之於民，用之於民。
1．欽州住房公積金管理中心的主要職責
⑴貫徹執行國家和自治區關於住房公積金管理的方針、政策、法律、法規，制訂欽州市住房公積金具體管理辦法；
⑵負責欽州市住房公積金的管理、運作；
⑶編制欽州市住房公積金的歸集、使用計劃，年度預決算，並組織執行；編報使用計劃執行情況的報告；
⑷負責欽州市住房公積金的保值和歸還；
⑸審批欽州市個人住房公積金的提取和個人住房委托貸款的發放；
⑹委托商業銀行辦理住房公積金個人住房貸款、結算等金融業務和住房公積金賬戶的設立、繳存、歸還等手續；
⑺負責欽州市住房公積金的統壹核算，指導、監督分支機構的內部核算；
⑻審核單位住房公積金繳存比例或者緩繳的申請，報市住房公積金管理委員會批準後執行；
⑼建立住房公積金個人明細賬，向個人發放繳存住房公積金的有效憑證及提取信息查詢；
⑽建立住房公積金管理中心及其所屬機構的業務監督信息系統，向上級報送住房公積金財務報告，並定期將信息向社會公布；
⑾擬訂欽州市住房公積金增值收益分配方案，報財政部門審核後執行；
⑿向財政部門及上級監管部門提出住房公積金呆賬核銷申請，辦理呆賬核銷；
⒀依據有關規定，代管公有住房的出售收入等其他住房資金，保證專款專用；
⒁承辦市人民政府、上級主管部門及市住房公積金管理委員會決定的其他事項