夫妻共同償還公積金貸款時，其中壹方賬戶為主扣款賬戶。系統將優先從主扣款賬戶扣款。扣款金額不足以償還本息時，會從另壹個人的賬戶發起扣款，直至全部扣款。當夫妻雙方公積金賬戶中的金額不足以扣款時，系統會按順序從還款儲蓄賬戶中扣款。
節約儲金提取流程:
1.單位核實職工個人提供的相關提取證明材料及復印件，單位符合條件的經辦人填寫住房公積金提取申請表和住房公積金管理中心統壹印制的住房公積金提取清冊，持相關證明材料原件及復印件向開戶管理部提出申請；
2.管理部人員對提取的材料、金額、次數、個人賬戶信息進行審核。對符合提取條件的，辦理提取手續；對於經審核不允許提取的，告知不允許提取的理由；對於特殊情況不能及時答復的，應征詢管理部主任和住房公積金管理中心相關部門的意見，並在三日內給單位明確答復；
3.對符合部分提取條件的，管理部人員應根據提取材料將相關信息錄入系統，建立首次職工住房公積金提取記錄單，並在購房發票(或購房收據、首付款發票、房租發票、完稅憑證、購房材料發票)上加蓋“住房公積金提取已辦理”字樣；
4、管理人員錄入《住房公積金支取清單》並確認個人儲蓄賬戶；
5.提取確認後，管理部人員打印《住房公積金提取申請書》和《住房公積金提取清冊》壹式兩份。如果取消提取，還需要打印個人住房公積金註銷利息對賬單。
綜上所述，雖然說是夫妻雙方共同還款，但是很多時候，只要主賬戶還清欠款，系統是不會發起從另壹個賬戶扣款的。
法律依據:
《住房公積金管理條例》第二十六條
繳存住房公積金的職工，在購買、建造、翻建、大修自有住房時，可以向住房公積金管理中心申請住房公積金貸款。
住房公積金管理中心應當自受理申請之日起15日內作出是否發放貸款的決定，並通知申請人；準予貸款的，受委托銀行應當辦理貸款手續。
住房公積金貸款風險由住房公積金管理中心承擔。