第二套房貸不能抵扣個稅。壹般情況下，只有首套房貸可以享受稅費減免政策，第二套需要按照房屋交易價格的1%的標準繳納。二套房貸和首套房貸在貸款金額、預期年化利率、貸款難度等方面存在差異。
首套和二套房貸可以免稅嗎？
第二套房貸不能抵扣個稅。壹般情況下，購房者只有在申請首套房貸時才能減免個稅。如果他們申請第二套房貸，就不能減稅。如果二套房貸想減免個稅，那麽購房者及其配偶需要遵守相關貸款規定。只要購房者能按照首套房的貸款利率貸款，那麽購房者在辦理二套房貸款時就可以減免稅收。
個人所得稅以實際交易價格作為轉讓所得征收。納稅人在計算轉讓住房收入個人所得稅應納稅所得額時，可憑原購房合同、發票等有效憑證，經稅務機關審核後，從其轉讓收入中扣除房屋原值、轉讓房屋過程中已繳納的稅款及相關合理費用。應繳納的個人所得稅=(實際成交價格-房屋原值-房屋過戶過程中繳納的稅費及相關合理費用)*20%。買賣第二套住房個人所得稅1%，可以由賣方繳納，也可以由買方約定。
二套房貸和首套房貸有什麽區別？
1.貸款額度不同:二套房貸款的貸款額度遠低於首套房。比如在北京，首套房借款人最高可貸70%，二套房借款人最高只能貸30%。具體貸款金額以地區規定為準。
2.貸款預期年化利率不同:二套房貸預期年化利率遠高於首套房貸。就公積金貸款而言，二套房貸款預期年化利率比首套房公積金貸款預期年化利率高10%。其他商業貸款的二套房貸預期年化利率應該是商業銀行規定的，但總體來說還是比較高的。
3.貸款難度不同:當然，二套房貸的貸款難度會比首套房貸大很多，尤其是資金緊張的時候，往往很難申請二套房貸。
三、如何用公積金貸款買二套房？
1.借款人需要攜帶身份證和貸款資料到公積金中心申請貸款並提交資料。
2.公積金中心審核，包括個人信息、貸款金額、貸款期限等內容。
3.審批之後，就要對貸款的房子進行評估。
4 .公積金中心與借款人簽訂的借款合同、貸款其他協議。
5.公積金貸款由合作銀行發放。