1、管理機構
南京開發區工委、管委會為南京市市委、市政府的派出機構，享有市壹級的經濟管理權限。
紫金（新港）特別社區建發公司、紫金（新港）科技創業服務中心具體承辦特別社區開發建設、運營管理、各類中介服務平臺建設以及創業孵化相關服務。
2、創新平臺
（壹）人才引進服務平臺
人才中心位於開發區興智路綜合管理大樓B段3～5層，總面積約5700平方米，中心承擔創業指導服務中心、就業管理服務中心、職業介紹服務中心、職業技能培訓鑒定中心四項職能，建立健全人才引進、人才配置、網絡招聘、人才派遣、人事代理、職業機能培訓、機能鑒定、資質認定培訓、咨詢服務、職業指導、職業介紹、信息發布等基本服務職能。
（二）創業投資服務平臺
新港特區所屬的南京經濟技術開發區已經設立或者參股眾多科技金融機構，主要包括：
（1）種子基金——南京市棲霞區科技創業種子基金；
（2）創業投資——南京新港科技創業投資有限公司、南京市棲霞區科技創業投資有限公司；
（3）跟進投資——南京高科新創投資有限公司；
（4）小額貸款——南京高科科技小額貸款有限公司；
（5）科技銀行——南京銀行股份有限公司；
（6）科技保險——紫金財產保險股份有限公司。
（三）公***技術服務平臺
新港特區充分發揮產業基礎以及科教人才優勢，大力整合優質的產學研資源建設各種公***技術服務平臺。目前，已建成或合作的平臺主要有：
（1）南京光電技術研究院；
（2）中科院上海光機所南京先進激光技術研究院；
（3）劍橋大學先進光子學與電子技術中心（CAPE）；
（4）國家平板顯示工程技術研究中心；
（5）江蘇省信息工程技術研究中心；
（6）南京出入境檢驗檢疫局智能產品分析檢測服務中心。
3、生活配套
區內仙林新區（仙林副城）規劃面積約80平方公裏，青山環抱，碧波蕩漾，建築密度低，環境保護好，是南京市高標準、高規格所建設的三大副城之壹。
經過10年來的發展，仙林新區已經開發47平方公裏，並擁有了管理服務、科研教育、文化娛樂、醫療衛生、商業、住宅等成熟的公***設施，成為南京東部新城。南京國際學校（南京唯壹、國內第壹所由國際文憑組織授權學校）、南京外國語學校仙林分校、南京師大附中仙林分校、南京鼓樓醫院仙林國際醫院（三級甲等）等機構均座落於此，提供了完善優質的生活配套。