第三方跨境支付業務的流程如下：
境內買家在境外網絡平臺提交商品訂單，並根據跨境支付平臺顯示的交易價格，向跨境支付平臺轉移應付款項。接著，跨境支付平臺向合作銀行進行批量購匯，通知境外賣家發貨。境內買家確認收貨後，跨境支付平臺向合作銀行發送清算指令，銀行通過銀行清算系統(SWIFT)直接將外幣貨款轉匯到境外賣家的交易賬戶， 整個跨境交易完成。
第三方跨境支付流程大致如此，07年，銀聯成為國內首家開展跨境支付業務的第三方支付公司。2012年，世界貿易組織認定銀聯存在壟斷行為。國家為了更好地發展第三方支付市場，終於確定允許其他第三方支付公司進入跨境支付服務領域。2013年9月，國家外管局發放了首批17張跨境支付牌照。2014年，第二批***5家第三方支付平臺獲得跨境支付牌照。進入2015年，跨境支付走向了法制化和規範化道路。國家外匯管理局正式發布了《國家外匯管理局關於開展支付機構跨境外匯支付業務試點的通知》和《支付機構跨境外匯支付業務試點指導意見》。允許部分擁有《支付業務許可證》且支付業務為互聯網支付的第三方支付公司開展跨境業務試點。截止2015年底，獲得該資格的支付平臺數量為27家。隨後的2016年，跨境業務試點企業數量維持不變。直至2017年春季，外管局才批準3家參與跨境試點。自此，擁有跨境支付資格的支付平臺數量達到30家。