1與蛋白質不同:棉籽粕粗蛋白含量低，棉粕吸水性強，口感相對較差，主要作為飼料中蛋白質的來源，而豆粕粗蛋白含量高，豆粕吸水性差，口感相對較好，也可作為飼料中的蛋白質補充。
2、價格不同:棉粕較粗，價格相對較低，產地主要在我國南方產棉區；豆粕比較粗，價格比較高。主要產於中國東北和內蒙古。