1000萬元，無論是非法營業額還是非法收入，都構成了特別嚴重的情況。雖然全部退回，量刑可以較輕，但不可能減輕，至少五年。根據最高人民檢察院、公安部關於經濟犯罪案件起訴標準的有關規定，違反國家規定，擅自經營國際電信業務或者涉及香港、澳門、臺灣的營利活動，涉嫌下列情形之壹的，應當起訴：
（1）經營100萬元以上；
（2）經營100萬元以上；
（3）未達到上述金額標準，但因非法經營國際電信業務或涉及香港、澳門、臺灣的電信業務，受到行政處罰2次以上，並進行非法經營活動。
非法經營量刑標準金額
我國法律規定非法經營，擾亂市場秩序，，情節嚴重的，處五年以下有期徒刑或者拘役，並處或者單處違法所得壹倍以上五倍以下罰金；情節特別嚴重的，處五年以上有期徒刑，並處違法所得壹倍以上五倍以下罰金或者沒收財產。
法律依據：
《中華人民***和國刑法》第二百二十五條
非法經營罪違反國家規定，有下列非法經營行為之壹，擾亂市場秩序，情節嚴重的，處五年以下有期徒刑或者拘役，並處或者單處違法所得壹倍以上五倍以下罰金；情節特別嚴重的，處五年以上有期徒刑，並處違法所得壹倍以上五倍以下罰金或者沒收財產：
（壹）未經許可經營法律、行政法規規定的專營、專賣物品或者其他限制買賣的物品的；
（二）買賣進出口許可證、進出口原產地證明以及其他法律、行政法規規定的經營許可證或者批準文件的；
（三）未經國家有關主管部門批準非法經營證券、期貨、保險業務的，或者非法從事資金支付結算業務的；
（四）其他嚴重擾亂市場秩序的非法經營行為。