1.轉基因大豆及其產品會造成跨物種感染，使人感染動物疾病，帶來嚴重的災難。轉基因食品中引入特定基因或病毒，為跨物種感染埋下了伏筆。轉基因食品引起的跨物種感染極具破壞性，必須格外小心對待。
2.轉基因大豆及其產品會損害人體的內部系統。與非轉基因大豆相比，轉基因大豆的成分發生了很大變化，如植物血凝素增加了約1倍，蛋白酶抑制劑增加了26.7%，而蛋白質和苯丙氨酸明顯減少，維生素B2復合物中膽堿的含量降低了29%等。這些變化可能會減緩人體的生長，使人變矮。轉基因大豆還含有壹種類似雌激素的化學物質，會破壞人體激素，導致生殖器官異常，損害免疫系統。此外，有證據表明，轉基因大豆食品與非霍奇金淋巴瘤發病率的增加有關。
3.轉基因大豆及其制品可能對人體產生過敏反應。世界上近2%的成人和4%-6%的兒童有過食物過敏，90%的過敏是由八種食物引起的:雞蛋、魚、貝殼、牛奶、花生、大豆、堅果和小麥。轉基因大豆由於引入了外源基因，可能更容易對人體產生過敏反應。世界上壹些國家的事實也證實了轉基因大豆在壹定程度上是過敏的。
4.轉基因大豆及其產品可能會影響人類對抗生素的耐藥性。外源基因導入轉基因大豆。如果這些抗生素標記基因進入人體，可能會轉移到有害的致病菌中，從而使其對抗生素產生耐藥性，降低抗生素的臨床療效，還可能使人體對很多抗生素產生耐藥性。
5.轉基因大豆中存在未知DNA，可能帶來新的不安全因素。轉基因大豆的研究很可能超出人類的控制，轉基因大豆很可能發生意想不到的變化，這當然可能給人類的健康和安全帶來新的風險。
美國大豆油的生產不同於我國傳統的壓榨法，而是采用“油浸法”精煉所謂“油浸法”就是將6 #汽油浸泡後加熱蒸發。問題是汽油中含有致癌雜質，這些雜質殘留在轉基因大豆油中。轉基因大豆+“油浸法”提煉，吃了這種油會得怪病。尤其不要給孩子吃。要小心，盡量避免吃這種油。目前中國市場上的食用油主要由三大公司生產，其中60%為美國獨資，到處都是美國公司生產的“金龍魚”食用油。首先要明確，所謂轉基因食品，就是把動植物的基因移動，改變，創造出具有新特性的食品類型。轉基因大豆通過將其基因移植到大豆植物中，可以更好地保護壹些細菌免受害蟲的侵害。所以轉基因大豆油和非轉基因大豆油在營養成分和組成上幾乎沒有區別，導致油脂加工企業往往對轉基因大豆油在這方面的隱患不做說明或者避而不談。然而，英國《獨立報》披露了轉基因食品巨頭孟山都公司的壹份秘密報告。報告顯示，給老鼠餵食轉基因玉米會導致血液變化和腎臟異常。消息傳出後，立即引起了社會各界的廣泛關註。由於國內最常見的轉基因食品主要是轉基因大豆油，這也導致消費者對轉基因大豆油的安全性產生擔憂。
其次，要明確轉基因食品確實存在以下五大隱患:壹是毒性問題。壹些研究人員認為，人工提取和添加基因不僅可能達到某些預期效果，還可能增加和積累食物中的微量毒素。二是過敏反應。對某種食物過敏的人有時會對以前不過敏的食物過敏。第三是營養。科學家認為，外源基因會以人們尚不知道的方式破壞食物中的營養成分。第四是對抗生素的耐藥性。當科學家將壹個外來基因添加到植物或細菌中時，這個基因將與其他基因相連。人們服用這種改良食品後，食品會將耐藥基因傳遞給人體內的致病菌，使人體產生耐藥性。第五是對環境的威脅。很多轉基因品種含有從芽孢桿菌中提取的細菌基因，會產生壹種對昆蟲和害蟲有毒的蛋白質。生態學家認為，其他不在改良範圍內的物種可能成為改良物種的犧牲品，而生物學家則擔心，為了培育出壹些更好的特性，它們的特性可能會通過花粉等媒介傳播給野生物種。
最後不得不說明的是，轉基因食品對人體是否有害，學術界尚無定論，至今也沒有出現因食用轉基因食品而引起不適的情況。歐洲國家認為，只要不能否認危險，就應該加以限制；美國堅持認為，只要不能從科學上證明它是危險的，就不應該加以限制。盡管爭論尚未有結論，轉基因研究仍在如火如荼地進行。也許妳不知道，中國有22種轉基因作物和樹木，轉基因棉花已經進入大規模商業化生產，成為世界上轉基因作物田間試驗和商業化生產面積第四大的國家。
中國農業大學食品生物技術實驗室副主任朱本忠說:“雖然沒有科學技術方法可以直接確定轉基因產品是否對人體有害，但轉基因大豆通過了國家質檢部門的安全評價，應該是安全的。”中國農業大學教授黃昆侖表示:“市場上銷售的所有轉基因食品都經過了國家相關質檢部門的檢測，並對其安全性進行了評估。目前，食用轉基因大豆8年的中國和美國，在消費者中沒有產生明顯的不良癥狀。沒有必要對轉基因大豆進行抵制。而且轉基因技術對農業的發展作用明顯，可以賦予農產品增產、防蟲等加工特性，前景光明。”從營養安全的角度看，沒有證據表明轉基因食品對人體健康不利，也不存在由此引發的食品安全糾紛。
根據2002年3月20日起施行的《農業轉基因生物標識管理辦法》，國家已將大豆種子、大豆、大豆油納入“標識管理”，所有轉基因產品都要在產品上進行標識:第六條標識方式: (壹)轉基因動植物(包括種子、種畜禽、水產苗種)和微生物、轉基因動植物和微生物產品，含有轉基因動植物、微生物或。(二)轉基因農產品的直接加工品，標註為“轉基因××加工品(成品)”或者“加工原料為轉基因××”。(三)使用農業轉基因生物加工的產品或者含有農業轉基因生物成分的產品，但最終銷售的產品不再含有或者無法檢測出轉基因成分，標註為“本產品使用轉基因生物加工，但本產品不再含有轉基因成分”或者標註為“本產品原料中存在轉基因生物，但本產品不再含有轉基因成分”。第七條農業轉基因生物標識應當醒目，並與產品的包裝和標簽同時設計和印制。轉基因食品對人體健康有害嗎？食用轉基因大豆油安全嗎？目前國際上沒有明確的結論。然而，世界上大多數國家對轉基因技術，尤其是轉基因食品持謹慎態度。
因為中國大豆產量低，大豆供給遠低於市場需求，生產成本比轉基因大豆高20%。轉基因大豆產量高，出油率高，價格低，所以很多食用油廠家選擇轉基因大豆，這就促進了“轉基因”大豆油的盛行。目前市場上銷售的大豆油大部分是轉基因食用油，市場上沒有轉基因標識的食用油非常少，價格也遠高於轉基因食用油。部分原產於東北的大豆油可能是非轉基因的，但東北大豆的產量小於轉基因大豆，不適合作為制油原料。
因為我國不限制使用“轉基因”原料，所以廠家選擇“轉基因”原料進行生產，主要是出於成本考慮。目前進口大豆100%都是轉基因大豆，出油率在20%-21%之間，而國產大豆出油率只有17%，但價格比進口大豆貴，所以大部分廠家都會用進口大豆做原料。據估計，平均每桶5升非轉基因大豆油比轉基因大豆油貴2-3元。因為國內大部分消費者對價格還是比較敏感的，對“轉基因”產品不太了解，也不太關註是不是“轉基因”大豆油。他們買食用油都是認準壹個品牌，對產品價格比較敏感，以價廉物美為首要考慮。90%以上的消費者沒有關註過轉基因食用油，近壹半的消費者表示不會讓孩子吃轉基因食品。大家普遍關心轉基因食品對人體健康是否有影響。
中國農業大學食品生物技術實驗室副主任朱本忠說:“雖然沒有科學技術方法可以直接確定轉基因產品是否對人體有害，但轉基因大豆通過了國家質檢部門的安全評價，應該是安全的。”中國農業大學教授黃昆侖表示:“市場上銷售的所有轉基因食品都經過了國家相關質檢部門的檢測，並對其安全性進行了評估。目前，食用轉基因大豆8年的中國和美國，在消費者中沒有產生明顯的不良癥狀。沒有必要對轉基因大豆進行抵制。而且轉基因技術對農業的發展作用明顯，可以賦予農產品增產、防蟲等加工特性，前景光明。”從營養和安全的角度來看，還沒有發現轉基因食品對人體健康不利。轉基因食品很多年前就出現了。轉基因食品對人有害似乎沒有確鑿的證據，至少我讀書的時候老師是這麽說的。(我是學食品的)，中國的大豆和花生都是轉基因的，或者說基本上，制油的好像都是轉基因的，所以不是國外進口的，主要是。歐盟好像不允許轉基因食品。我們仍然是壹個發展中國家。只有糧食問題徹底解決，經濟發展起來，才有可能考慮是否轉移轉基因。如果吃轉基因大豆能讓人不育，那我就不知道是誰天天在電臺做的小廣告了，呵呵！