天門燒開的水之所以被稱為“謎”，是因為有許多無法解釋的現象。壹般來說，汛期處於雨季，降雨量比較大的時候會出現壹些洪水等現象。但這種奇觀總是出現在旱季，在幹旱無水的情況下水就會沸騰。這種奇觀是不規則的，有時每十年壹次，有時每幾十年壹次，每次持續15-45分鐘後，又會歸於平靜，不著痕跡。
但既然是瀑布，就應該有源頭。這是不可改變的自然規律，但每次天門山翻水時，它似乎憑空出現又憑空消失。
還有壹點，也是最難解釋且沒有科學依據的壹點是，天門山每次落水都與中國壹些歷史事件發生的時間密切相關。
1949年，記載天門河第壹次翻江。中華人民共和國（PRC）在水翻後不久成立。
1965年，天門第二次翻水，不久，文化大革命全面爆發。
1976年，第三次天門調水工程後，發生了壹場毀滅性的唐山大地震，令世界為之惋惜。
每次遇到這些驚人的巧合，都會隨著時間的推移給天門山蒙上神秘的色彩，成為當地人心中的壹個謎。