如果金額不夠，借款人需要從銀行卡中補足。比如房貸每月需要還2500元，而公積金賬戶只有2000元，那麽可以全部扣回500元。
公積金按揭還款直接從公積金中扣除:
房貸還款可以從借款人的公積金賬戶中扣除，因為只要借款人在本市購買了擁有全部產權的自住住房，主貸款人及其配偶沒有其他公積金貸款債務和還款業務，房貸經辦銀行也提供還款業務，那麽借款人壹般都可以用住房公積金申請房貸還款。
住房公積金不僅用於購買、建造、翻新和大修住房。公積金除了還貸款，還可以用來交房租或者補貼經濟困難的家庭。
如果要還公積金貸款業務，借款人需要準備好個人身份證、戶口本(結婚證)、購房協議、貸款合同、支持住房公積金的聯名公積金卡或銀行卡(貼息)、之前住房貸款的還款明細。
借款人使用公積金還房貸時，可以選擇年按揭，即每年向銀行申請從公積金賬戶提取壹定余額，壹次性償還貸款本金；也可以選擇月供，即每月從公積金賬戶提取公積金，用於償還當月的貸款本息。