(壹)涉及面廣，以信貸為重點區域。從已經查出和暴露的違規操作和各類案件看，涉及到存款、信貸、投資、融資、結算、財務會計、安全保衛、計算機等業務的方方面面，幾乎每個業務領域均有違規、違章、違紀、以致違法現象。信貸業務是農村信用社的主要資產業務，也是操作風險多發部位，造成的危害也最大，信貸違規違紀現象多種多樣，違規手法五花八門。
壹是對同壹貸款戶由多個信用社多次發放貸款，從而達到化整為零、逃避貸款審批的現象較為嚴重，成為違規發放貸款的主要形式，造成貸款損失嚴重。
二是貸款管理不嚴，貸款跟蹤檢查不到位，貸款管理制度形同虛設。
三是信貸檔案資料不規範、不全面，給貸款安全留下隱患。
四是貸款形態反映不真實，沒有及時做好貸款五級分類。有的信用社還違規辦理不符合條件的借新還舊貸款；跨地區、壘大戶等其它違規貸款也屢見不鮮。
(二)危害性大，以侵占資金為目的。由於農村信用社操作風險涉及面廣，發生的頻率高，而且大部分操作風險是主觀性的以侵占資金為主要目的的道德因素引起的，因此對農村信用社危害性相當大。
壹是大大降低了貸款質量。農村信用社實施改革前，全國農村信用社實際不良貸款率在50%以上。
二是造成直接資金損失。違規拆借資金、攜款潛逃、票據詐騙、計算機犯罪、安全保衛事故、櫃臺操作失誤等均帶來嚴重的資金損失。
三是留下風險隱患。有的操作風險雖然不直接或立即造成損失，但卻留下風險隱患，給經營帶來無法估量的困難。
四是引起法律糾紛。由於制度不健全、操作不規範，存在法律漏洞，容易引起法律糾紛，壹旦對簿公堂極有可能處於不利的法律地位。無論采取何種形式，操作風險制造者其主要目的無不是為了侵占資金，給農村信用社帶來的後果是資金損失和風險增加。