1868年，由於復辟勢力和倒幕運動的勝利，日本結束了漫長的“雙重統治”時代。當時，很多西方人都認為勝利者或許會推行壹種極為保守的孤立主義的政策，但事實是，新政從壹開始就采取了與他們的預料截然相反的政策。在壹年內，新政策就廢除了大名在各藩征稅的權力。另外，在審批土地使用權問題上，也同樣作了改變，原來的政策是“四公六民”，也就是農民要把自己收成中的四成交給大名，而在新的政策中，這“四成”則由政府來提取。同時作為補償，政府還會給每個大名發放相當於他們正常收入壹半左右的俸祿，並且免去他們應該交給政府的若幹費用，例如用於公***建設和供養武士的費用。而武士則和大名壹樣，靠政府頒發的俸祿為生。
在隨後的五年內，新政府又逐步在法律上進行明文規定，不能由於階層的不同產生特權思想，同時廢除了不同階層的人著裝必須有區別的規定，甚至開始下令“散發”。賤民由此被解放了，各藩間的關卡被解除了，禁止土地轉讓的法令也壹並被廢除，佛教的國教地位也逐漸被取消。到了1876年，政府又開始把大名以及武士的俸祿折合成貸款，壹次性發放，還款期限從五年到十五年不等。貸款的數額則按照在德川時代所領取的固定俸祿額而定。在那個新的非封建經濟時代，這筆錢甚至足夠讓他們開壹個小公司了。
其實在德川時代，封建土地貴族、金融巨頭和商人的聯合已經很明顯了，新政府采取的措施是要預防這種現象擴大。剛開始時，明治政府采取的這壹系列激烈的改革措施並沒有得到大家發自內心的擁護。因為相對於這些措施而言，當時的老百姓其實對侵朝方案更加有興趣。面對這種狀況，明治政府不僅從來沒有改變過自己的改革方案，甚至徹底地否決了侵略朝鮮的計劃。在這種情況下，政府的施政方針基本上與當初建立明治政府的初衷發生了強烈的沖突。到1877年，這些矛盾甚至演變成了西鄉隆盛領導的壹場頗具規模的反政府叛亂。他帶領的軍隊是由前封建的殘余力量中的保皇派組成的，他們有著維持封建制度的願望，明治政府在復古後的第壹年就叛離了這種願望，這成為西鄉隆盛的軍隊叛亂的理由。很快，政府利用招募來的壹支平民義勇軍擊敗了西鄉隆盛的叛亂軍。
雖然這場叛亂最終被平息了下去，但不能否認，這場戰役本身說明了日本民眾對當時政府所實行的改革政策的不滿已經達到了壹定的程度。這種對新政府的強烈不滿也同樣存在於農民中。1868年到1878 年，也就是明治政府統治的前10年間，日本爆發了不下於190 次的農民起義。1877 年，新政府才開始逐漸減輕壓在農民身上的重稅，難怪農民感到他們太被新政府忽視。還有許多問題同樣引起了農民們的強烈不滿，例如建立學校的制度、征兵制度、遣散方案、丈量土地的方案、給予賤民平等待遇的問題、改用陽歷問題、官方限制佛教問題以及其他許多改變了他們生活習慣的問題。