工程預付款表明工程已經實質性開工。實質上，預付款是由雇主支付的，作為動員和項目準備的無息貸款。
2、預付款的抵扣:預付款本質上是壹種“無息貸款”，接下來就是還款的問題，在施工合同中，這種還款是以“抵扣”的形式進行的。即隨著工程的進展，工程進度款的金額在增加，工程所需的主要材料和構件的金額在逐漸減少。原來的預付款要陸續扣。
扣除的方法是從預付材料金額中扣除建築工程中仍需使用的主要材料、構配件的價值，從每次工程價款中間結算中按材料、構配件的比例扣除工程價款，直至竣工。因此，確定提前還款扣款的時機以及每次提前還款扣款的比例，是提前還款條款中最需要解決的問題。
3.預付款金額的約定:根據我國《建設工程價款結算暫行辦法》第十二條“承包和包工包料工程預付款按合同約定分攤，原則上預付款比例不低於合同金額的65，438+00%，不超過合同金額的30%。對於重大項目，應根據年度項目計劃逐年預付。
對於采用《建設工程工程量清單計價規範》(GB50500—2003)的工程，預付款的比例應在合同中約定為實質性消耗和非實質性消耗。顯然，根據我國法律規定，預付款的比例為合同金額的10%~30%，在訂立合同時不應超過此範圍。
4、預付款開始扣除的時機:確定預付款扣除點的依據是:未完工程所需的主要材料和構件的成本等於預付款的金額。在實際工作中，項目預備費的回扣方式也可以由發包人和承包人以合同形式協商確定，也可以根據項目的實際情況具體辦理。
如果有的項目建設周期短，成本低，就不需要分期扣除；壹些建設周期較長的項目，如跨年度項目，占用預備費時間較長，可根據需要少扣或不扣。
在國際工程承包中，FIDIC施工合同也規定了工程預付款的回扣。方法相對簡單。壹般當工程進度款累計金額超過合同價的65，438+00%時，每月按25%的比例從支付給承包人的工程款中扣除。
5.預付款每次扣回比例的約定:扣回比例可由雙方約定，但應在所有款項支付前全部扣回，因此每次扣回比例不得低於預付款占合同價格的比例，由雙方協商確定。
百分比法。百分比法是根據年度工作量的壹定比例確定預付材料金額的方法。各地區、各部門根據自身情況，制定了本地區、本部門預付物資的比例。
數學計算方法。數學計算法是根據主要材料(包括結構件)占年度合同工程總價的比例、材料儲備定額天數和年度施工天數，通過數學公式計算出備料預付款金額的方法。
經協商同意。在許多情況下，它是由合同雙方自願協商確定的。在談判過程中，建設單位作為承包商，應努力爭取更多的資金用於材料的準備，以確保施工有壹個良好的開端，能夠正常進行。
擴展數據:
建設工程合同是指當事人壹方同意完成建設工程，另壹方按照約定接受工程並支付壹定報酬的合同。前者稱為承包商，後者稱為雇主。建設工程合同包括工程勘察、設計和施工合同，是壹種特殊類型的承包合同。因此，法律對建設工程合同沒有特別規定的，適用法律對承包合同的有關規定。
隨著我國經濟的發展，基本建設作為重要的工業支柱，在國民經濟發展過程中發揮著不可或缺的作用。同時，相應的法律法規也在不斷完善，以保證經濟發展的順利進行。
百度百科-施工合同
北京大學法律信息-國家工商行政管理局經濟合同仲裁委員會關於定金和預付款性質的答復