銷售農民專業合作社成員生產的農產品，視同農業生產者銷售自產農產品，免征增值稅；壹般納稅人從農民專業合作社購進的免稅農產品，可按13%的抵扣率抵扣進項增值稅；農民專業合作社向合作社成員銷售的農膜、種子、種苗、化肥、農藥和農業機械，免征增值稅；農民專業合作社及其成員簽訂的農產品和農業生產資料購銷合同，免征印花稅。
第二，金融支持政策
國家將農民專業合作社全部納入農村信用評價範圍；加大信貸支持力度，重點支持產業基礎紮實、經營規模大、品牌效應高、服務能力強、農戶多、規範管理好、信用記錄好的農民專業合作社；支持和鼓勵農村合作金融機構創新金融產品，改進服務方式；鼓勵有條件的農民專業合作社發展信用合作。
三。金融支持政策
2003年至2010年，中央財政共安排專項資金18多億元，主要用於支持農民專業合作社增強服務功能和自我發展能力。農機購置補貼財政專項資金明年仍將優先用於農民專業合作社。
四。涉農項目支持政策
2010農業部等七部委決定將農民專業合作社納入適合農民專業合作社的農業項目申報範圍；尚未明確納入申請範圍的農民專業合作社，要盡快納入，明確申請條件；今後新的涉農項目，只要是適合農民專業合作社的，都要納入申請範圍，明確申請條件。
目前，農業部蔬菜園藝作物標準園建設、規模化畜禽養殖場(小區)建設、健康養殖示範場建設、新壹輪“菜籃子”工程、糧食高產創建、標準化示範工程、國家農業綜合開發項目等已全部委托給符合條件的農民專業合作社。2017合作社將承擔更多申報項目的職能。
動詞 （verb的縮寫）農產品流通政策
國家繼續鼓勵和引導農民專業合作社與大型連鎖超市、高校食堂、農業生產企業等市場主體實現產(供)銷銜接。
第六，人才支持政策
從2011開始，農業部組織實施現代農業人才支持計劃，每年培訓1500名合作社帶頭人。明年繼續將農民專業合作社人才培訓納入“陽光工程”，重點培訓合作社負責人、會計和基層合作社輔導員。同時，鼓勵大學生村官參與和領導合作社。(喵喵寶)