性質和根源不同的不征稅收入是指不屬於企業營利活動所帶來的經濟利益，不承擔納稅義務，不屬於應納稅所得額的收入。不征稅收入包括依法收取並納入財政管理的財政撥款、行政事業性收費和政府性基金；免稅收入是指屬於企業應納稅所得額但根據稅法規定免征企業所得稅的收入。免稅所得包括符合條件的居民企業之間的債務利息、股息、紅利所得，在中國境內設有機構、場所的非居民企業從與該機構、場所有實際關聯的居民企業取得的股息、紅利所得，以及符合條件的非營利性公益組織取得的所得。
具體為:1，範圍不同。
不征稅收入:（1）財政撥款；（二）依法收取並納入財政管理的行政事業性收費和政府性基金；（三）企業獲得的國務院財政、稅務主管部門規定並經國務院批準用於特定用途的財政資金。
免稅收入:（1）債務利息收入免稅。（2）股息、紅利等股權投資收益按稅法規定的條件免稅。
對於國家公益性行業的經濟來源是否有經濟效益，壹般會視為免稅收入，不予征稅。如果企業或個體工商戶從事經營，其主要目的是盈利，則需要收取稅費。不征稅收入不產生經濟利益。
進項稅抵扣規則不同。不征稅收入:增值稅相關文件中沒有不征稅收入對應的進項稅額不能抵扣的規定。不征稅收入對應的進項稅額不需要轉出。免稅收入:免稅項目對應的進項稅額不能抵扣，已抵扣的進項稅額需要轉出。
不同發票的不征稅收入:目前，貨物和服務稅的分類和編碼支持16種不征稅收入（如預付卡銷售和充值、建築服務預付款等。）開具不征稅發票，其他不征稅收入只需開具收據。免稅收入:納稅人按規定享受免稅優惠時，開具註明稅率或征收率欄次的普通發票的，應在稅率或征收率欄次填寫“免稅”字樣。
申報填寫不同不征稅收入:不征稅收入不屬於增值稅的應稅範圍，不需要在增值稅納稅申報表中反映。免稅收入:免稅收入需要填寫增值稅納稅申報表，在報表中免稅對應欄中體現。
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法律依據:
《中華人民共和國企業所得稅法》第七條
收入總額中的下列收入為不征稅收入:（壹）財政撥款收入；（二）依法收取並納入財政管理的行政事業性收費和政府性基金；（三）國務院規定的其他不征稅收入。
第二十六條
企業的下列收入為免稅收入:（壹）債務利息收入；（二）符合條件的居民企業之間的股息、紅利等股權投資收益；（三）在中國境內設立機構、場所的非居民企業從居民企業取得與該機構、場所實際相關的股息、紅利等權益性投資收益；（4）合格非營利組織的收入。
第五十四條企業所得稅按月或者按季預繳。企業應當自月份或者季度終了之日起15日內，向稅務機關報送預繳企業所得稅納稅申報表。企業應當自年度終了之日起五個月內，向稅務機關報送年度企業所得稅納稅申報表，辦理匯算清繳，結清應退稅款。企業報送企業所得稅納稅申報表時，應當按照規定附送財務會計報告及其他有關資料。
《中華人民共和國企業所得稅法實施條例》
第壹百二十八條企業不論納稅年度的利潤或者虧損，都應當按照企業所得稅法第五十四條規定的期限向稅務機關報送預繳企業所得稅申報表、年度企業所得稅申報表、財務會計報告以及稅務機關要求報送的其他有關資料。
中華人民共和國增值稅法
第二十二條下列進項稅額不得從銷項稅額中抵扣:（壹）為簡易計稅項目、免征增值稅項目、集體福利或個人消費購進的貨物、服務、無形資產、不動產和金融商品所對應的進項稅額，其中涉及的固定資產、無形資產和不動產僅指專用於上述項目的固定資產、無形資產和不動產；（2）異常損失項目對應的進項稅額；（三）購進並直接用於消費的餐飲服務、居民日常服務、娛樂服務對應的進項稅額；（4）購買貸款服務對應的進項稅額；國務院規定的其他進項稅。
中華人民共和國國家稅務總局關於營改增試點征收管理若幹問題的公告。
（11）增加6項“無銷售額的不征稅項目”，供納稅人收取款項但不銷售貨物、應稅服務、服務、無形資產或不動產時使用。“不征稅項目”項下有601“預付卡銷售及充值”、602“自行開發房地產項目預付款”、603“申報繳納營業稅未補開發票”。使用“無銷售行為的不征稅項目”代碼，發票稅率欄應填寫“不征稅”，不得開具增值稅專用發票。