襄陽住房公積金管理中心內設六個職能科室。其主要職責分別是：
（壹）辦公室。
負責綜合協調，督辦各項工作落實；負責行政事務、新聞宣傳、文秘、保密、檔案管理工作；負責政策宣傳；負責考勤、會務安排及內外接待；負責信息系統管理；負責固定資產、車輛管理、後勤保障、安全保衛工作。
（二）人事監察科。
負責機構編制、工資、人事檔案和離退休人員的管理；負責幹部考察、任免、交流和年度考核工作；辦理幹部的調入調出手續；負責黨務、紀檢監察、群團、工會等工作；負責崗位培訓、繼續教育、學歷教育的組織管理工作。
（三）財務核算科。
負責各類住房資金的財務管理和會計核算工作；負責編制各類住房資金年度預算、決算，定期向襄樊住房公積金管理委員會和財政部門報送財務報表，接受審計部門的審計監督；負責住房資金的合理調度與平衡，確保資金的保值與歸還；負責檢查、督促受托銀行做好住房資金核算、結息工作；負責建立住房資金計算機管理系統並提供各類查詢 服務。
（四）貸款管理科。
負責受理、審核公積金個人抵押貸款業務；負責向審貸委員會報送借款人有關資料，經審貸會議討論通過後辦理個人貸款的發放；負責對受托銀行代辦公積金個人抵押貸款業務情況進行監督、檢查與指導；負責對已發放的個人貸款本息的按期回收並進行動態管理；負責組織催收逾期項目貸款本息；負責對各類抵押貸款文書及其他檔案材料的管理。
（五）歸集管理科。
負責擬訂住房公積金繳存比例並報襄樊住房公積金管理委員會審批後執行；負責擬訂住房公積金歸集、使用計劃；負責收集住房資金歸集、管理、使用情況；負責擬訂住房資金管理實施細則；負責住房公積金、房改售房款、貨幣化補貼資金的歸集業務，辦理各單位住房公積金繳存登記及匯繳；督促各單位及時辦理職工住房公積金的繳存，並負責落實各單位住房公積金繳存比例、額度的按年調整；負責落實困難單位住房公積金的緩繳材料。
（六）審計法規科。
負責建立健全內部審計制度；負責對系統內住房公積金制度執行情況、公積金計劃、預算執行情況和資金運用、財務收支、會計核算等情況進行內部審計和監督檢查；負責本行政區域內住房公積金行政執法工作；負責行政復議、行政處罰和行政訴訟工作；參與中心對外合同的審核簽訂、負責合同糾紛及相關資產保全訴訟；負責實施不良資產的管理、抵押物和償貸物的處置以及呆壞帳核銷的審核；負責組織實施系統內住房公積金管理工作年度考核辦法的修訂和考核工作。