清算系統是為該系統服務的相關機構或關聯機構。通常是兩個獨立清算系統之外的第三方付費清算服務。
金融支付結算系統承認結算機構是證券市場的“心臟”。同時，美元結算從法律層面積極保護結算機構作為特殊法人的權益。特別是美元結算，應規定結算參與人作為結算業務的受益者，有相應的義務維護結算機構的正常運轉。
擴展數據:
金融機構之間的債權債務和應收應付賬款，通過中央銀行經常項目的借貸記錄進行轉移和清算。跨行結算需要通過跨行支付系統進行，跨行支付系統為銀行自身和客戶委托的結算事項提供資金結算服務。
不同國家的中央銀行提供支付清算服務的方式和範圍不同，但業務操作原則基本相同。為了利用中央銀行的支付和清算服務，金融機構需要在中央銀行開立經常賬戶。中央銀行通常要求金融機構在其賬戶中保留壹定數量的準備金，以確保支付的順利進行。
資金結算流程包括兩個基本程序。壹種是付款行通過支付系統向收款行發送支付信息；二是實現付款行和收款行之間的資金劃轉。根據轉入資金處理方式的不同，跨行清算可分為差額清算制和全額清算制兩種。