（壹）相同點
壹是兩種加工貿易都經歷了“進口—加工—出口”三個環節。
二是兩者具有***同監管方式，即對用於加工制造出口產品的進口料件實行海關保稅監管，在進口時進行監管登記，免征關稅和增值稅，產品出口時由海關核銷進口料件。
（二）不同點
壹是原材料、零部件和產品的所有權不同。來料加工是由外商免費提供原材料、零部件、元器件、生產加工的產品完全歸外商所有，由外商支配；而在進料加工中，經營單位對原輔料和生產加工出來的成品擁有所有權。
二是兩者的貿易性質不同。在來料加工業務中，外商與經營單位是委托與被委托關系，經營單位接受外商委托並要按外商的要求進行生產加工，收取工繳費，純屬加工貿易性質；而在進料加工業務中，經營單位是自主經營，與銷售料件的外商和購買我成品的外商均是買賣關系，經營單位從中賺取銷售成品與進口原材料之間的差價，使外匯增值，屬於壹般國際貿易性質。
三是產品的銷售方式不同。在來料加工業務中，生產加工出來的產品由外商負責運出我國境外後自行銷售，銷售的好壞與我方毫無關系；而在進料加工業務中，經營單位在產品生產加工出來後要自己負責對外推銷，產品銷售情況的好壞與自己密切相關。
四是稅收政策規定不同，進料加工復出口貨物實行退稅（或免抵退稅），來料加工復出口貨物實行免稅。