1945二戰結束後，美國再次統治菲律賓，恢復菲律賓“自治政府”。以奧斯米納為首的菲律賓政府把經濟重建的希望寄托在美國政府身上，但得到的援助遠遠沒有解決菲律賓經濟面臨的嚴重困難。迫於壓力，美國被迫同意於1946年7月4日如期“授予”菲律賓“獨立權”。羅哈斯當選總統，菲律賓重新建立共和國。然而，美國政府卻強迫菲律賓政府接受《平等權利法》，簽署《美菲貿易協定》、《軍事基地協定》、《軍事援助協定》、《防務條約》等壹系列不平等條約，繼續控制菲律賓經濟命脈。從65438年到0953年，馬格賽賽在美國的支持下當選總統。他壹方面進行土地改革和農業信貸合作，另壹方面在貿易和外交上繼續依賴美國。65438年至0957年，因馬空難身亡，副總統加西亞繼任總統，實行經濟緊縮和“菲人優先”政策，經濟困難和社會矛盾相對緩解。1961年，馬卡帕加爾當選總統，通過土地改革法案，取消外匯管制，放開企業管理，外交上主張“重返亞洲”。1962年，菲律賓政府宣布將菲律賓獨立日由7月4日改為6月12日(菲律賓擺脫西班牙殖民統治的日子)。
1965馬科斯當選菲律賓第六任總統。在執政的頭兩年裏，政府在清理官僚主義、遏制腐敗和打擊走私方面取得了巨大成就，但發展經濟的計劃卻受到資金短缺的困擾。後來，在東南亞民族解放鬥爭和國內民族主義浪潮的影響下，馬來西亞調整了外交政策，逐漸擺脫美國的控制和影響，尋求在國際事務中發揮更積極的作用，放棄了近20年來不與社會主義國家交往的政策。1969年馬連任總統後，菲律賓再次面臨嚴重的經濟困難和社會動蕩，南部叛亂和菲間武裝鬥爭加劇，統治集團內部矛盾激化。從1972到1981，馬來西亞政府實施戒嚴，廢除兩院制議會和多黨制，改為壹院制“國民議會”。前期(1973-75)經濟發展迅速，社會矛盾和叛亂得到遏制，但後期馬來西亞獨裁統治加劇，全國民眾抗議運動興起。1983 8月21日，菲律賓反對黨領袖、前參議員貝尼尼奧·阿基諾從美國流亡歸來時在機場遇刺身亡，導致政局急劇惡化。反政府運動更是高漲。在這種壓力下，馬被迫宣布提前於1986年2月7日舉行總統選舉，但賄選醜聞引發了壹場前所未有的“人民力量革命”，阿基諾夫人科拉松·阿基諾在人民、天主教會和軍隊的支持下成為總統。馬和他的家人逃到了美國。