“二清”的危害是巨大的，本應由入駐商戶因提供產品或服務而收到的貨款，由於線上平臺型機構的關系，資金結算多出了壹道流程，而這道流程暗藏著巨大的風險，如果線上平臺型機構經營不善或者挪用資金，將導致平臺上商戶遭受不必要的損失。這種風險，不是靠“大而不會倒”就可以消弭，而應以透明、規範來避免。近壹年來，監管多次頒布規範性文件，三令五申打擊“二清”行為，就是防範於未然，消除“二清”行為的風險隱患。
“二清”機構是未獲得人民銀行支付業務許可證，在持牌收單機構的支持下實際從事支付業務的機構，這些機構可以是經過工商登記的普通商戶，也可以是線上平臺型機構。“二清”至少有以下幾個特征：壹是大商戶模式，平臺類電商模式；二是商戶是無證機構拓展的；三是持證機構將資金結算到無證機構指定商戶賬戶；四是無證機構經由指定商戶賬戶處理後再清分結算至二級商戶的收款賬戶。
線上平臺型機構利用輕量級平臺集約化經營模式，為眾多中小型商戶創造電商化便利、擴展銷售渠道；但與此同時，也帶來了壹系列的值得的問題：壹是平臺集中收款，資金滯留平臺，形成事實上的“資金池”，當“資金池”達到壹定規模，容易造成系統性資金風險；二是無證機構向平臺入駐商戶清算交易資金，遊離於監管體系外，無法保證平臺提供的交易信息的真實性，有可能存在偽造、變造交易信息，套取商戶和用戶資金的行為；三是部分線上平臺型機構為支付便捷，違規存儲持卡人的敏感信息，造成銀行卡信息和金融消費者信息泄露的風險。