托管管理是壹項復雜的系統管理工種，不僅涉及托管管理主客體三方(委托方、受托方、被委托方)，還涉及托管管理主客體的標的物(企業、資產、新增投資)，以及托管投資、產品生產銷售、金融、稅收、保險、外貿、運輸等制約這些環節的各種業務環節。環境的不確定性必然導致托管運營對每壹方、每壹個標的物、每壹個環節、每壹個因素都存在風險。因此，我們可以根據主客體的不同，將這種風險分為兩類:主體風險和客體風險。
(1)主體風險。主體風險是指企業托管運營主體在企業托管運營過程中的不確定性所導致的目的和收益的變化，也稱相對可控風險。受托人的不確定性包括兩個方面:壹是指受托人與客體的合同責任的履行程度、合同目標預測的可收縮性和執行結果的差距(可能無法實現或可能大大超出)；二是指托管運營標的評估概率的準確性和新托管投資風險的不確定性。這類風險主要包括信用風險、決策風險、操作風險和管理風險。
①信用風險。是指企業托管運營中三方對另壹方的全部或部分責任不能按時履行的風險，也稱違約風險。委托人的違約風險主要表現在委托過程中沒有明確的委托目標，腦子裏有無數的委托企業或資產，沒有具體的計劃和安排，委托目標制定得不切實際；在選擇受托人時，盲目擴大信用，沒有嚴格審查受托人的信用，沒有履行嚴格完善的托管運作法律程序。受托人違約風險主要表現在托管標的物選擇倉促、對標的物審查或評估不嚴、盲目實施托管投資、缺乏嚴格全面的托管實施方案。受托人違約風險主要表現在受托企業或資產賬目不清，受托企業人、財、物的管理和處置約定不明確，在托管過程中放棄權利義務。
②決策風險。指參與企業托管運營的各方決策水平差、決策程序不正常帶來的風險。沒有壹套嚴謹科學的決策程序和方法，沒有充分的沒收市場調研、科學的可行性研究、準確的效益評估和嚴謹的托管管理方案，單純依靠經驗、拍腦袋、壹時的熱情和逆向程序，會帶來決策的失誤和風險；但是，如果個體決策者沒有足夠的知識水平，沒有集中集體的智慧和意見，獨斷專行，也會存在因其對個人決策的片面理解、對信息的占有不足和個人能力低劣而導致決策判斷失誤的風險。
③操作風險。指企業托管運營過程中，因投資方向選擇或經營行為的變異、失誤而導致的風險。主要表現在兩個方面:
壹是對托管企業或托管資產的市場分析不透徹，自身托管運營實力不準確，新增托管投資目標不明確，或托管企業或托管資產目標確定不當，導致企業托管運營方向選擇錯誤而引發的經營風險。
二是商業行為的變異及其與市場變化的脫節。即企業托管運營的投資方向確定後，托管運營行為不能按照企業托管運營的實施方案組織實施，托管運營者自覺或不自覺地以變異的觀點影響運營行為，使企業托管運營的方向和目標發生偏離，未能準確把握托管運營過程中市場需求的變化，以市場需求調整托管運營行為面臨的風險威脅。
④管理風險。指企業托管過程中因管理不善、方法不當而導致的風險。企業托管經營的最大特點是企業法人財產權的轉移。托管管理的對象是系統化的企業或企業資產，包括人、財、物、產、供、銷整個系統。這個企業或系統不可避免地存在這樣或那樣的問題、缺陷和不足。為此，托管管理的關鍵是如何在現有企業和企業資產的條件下，運用科學的管理方法、嚴格的管理制度和個性化的管理手段，調動企業人員的積極性，發揮企業資產的效用，配合企業管理行為，實現企業托管管理的目標。如果不能通過管理有效調動企業人員的積極性和主動性，有效利用企業資產進行經營，必然會因委托企業人、財、物、產、供、銷等環節原有的困難、缺陷和不足而給托管經營帶來管理風險。
(2)對象風險。客體風險是指受委托經營主體以外的因素影響或事件的波動而導致的風險，也稱相對不可控風險。企業托管是在市場經濟條件下進行的。環境的不確定性客觀上影響了不可預測的因素和事件，導致托管目標實現的風險。這就要求托管的決策者充分認識這些因素和事件的客觀性和危害性，制定相應的應急措施，通過各種管理方法和活動盡可能地降低這種客體風險。這類風險主要包括不可抗力風險、政策風險和市場風險。
(1)不可能強行冒險。指由自然原因引起的頻繁破壞性事件造成的風險。主要有火災、洪水、海嘯、臺風、雷擊、地震。它們通常是不可預測和可預防的，也不是人為可控的。但從托管運營的角度來看，如果采取保險等措施應對這些自然災害，可以減少或降低這種風險給托管運營帶來的直接損失。
②政策風險。指國家政策變化對企業托管運營造成直接或間接損失的可能性。主要表現在我國從計劃經濟體制向市場經濟體制轉軌過程中政策的多變性，特別是隨著經濟體制改革的深入，以體制和管理為主體的各種政策變化對企業托管經營的影響。
③市場風險。是指市場競爭程度和市場需求變化導致的收益的不確定性和損失的可能性。市場風險因素有很多，主要體現在以下三個方面:
首先是同業競爭的風險。即市場上同行之間競爭失敗導致的風險。隨著市場經濟的發展，人類社會已經進入知識經濟階段，科技知識的快速持續發展使得同業競爭的激烈程度難以預料。因此，橫向競爭的焦點是知識競爭。面對激烈的市場競爭和強大的競爭對手，如果我們不利用信息、技術、管理、人才和資金利用以及市場服務等方面的高科技知識，就有可能在同業競爭中被淘汰。
二是市場需求變化的風險，也稱商業風險。即在市場經濟中，很多市場因素影響著需求變化帶來的風險。比如，由於市場需求和訂單減少，銷售收入減少，利潤減少。國際國內經濟環境的變化、經濟增長速度和社會不良資產狀況是影響市場需求變化的主要因素。我們必須隨時關註這些因素的動態變化，進而預測其需求的變化並調整其公司托管行為與之相適應，從而控制風險。
第三是財務風險。即在貨幣融資過程中，市場因素對貨幣、貨幣資金、融資方式和融資機構影響的不確定性所導致的風險。市場金融風險主要是由經濟周期性波動引起的。主要內容是利率風險、匯率風險和金融工具風險。利率風險是指市場利率的變動給企業托管運營帶來損失的可能性。匯率風險是指外匯價格或匯率變動給企業托管經營造成損失的可能性。利率風險是指外匯價格或比率的變動給企業托管運營帶來損失的可能性。利率主要取決於社會平均利潤率和資金供求關系；世界貨幣體系中各種貨幣的匯率必須隨著世界經濟形勢和國際匯率體系的變化而相應調整。因此，利率和匯率的變化必然會影響企業托管運營的投資成本、生產成本和銷售成本，也會在壹定程度上影響其在市場上的銷售能力。金融風險是指運用金融工具的融資方式和金融機構在貨幣融資過程中的信用風險。金融工具具有償還性、可轉移性(流動性)、安全性和收益性四個特征，這四個特征相互依存，又是不平衡的。壹般來說，流動性與盈利性成反比，與安全性成正比，安全性往往與盈利性成正比，而金融工具是通過融資方式和融資機構來實現的。因此，在選擇金融工具時，我們必須考慮融資方式和融資機構的風險因素。