大陸未成年居民申請往來臺灣通行證，應當按照規定填寫申請表，回答相關詢問，並提交下列材料:
1.按照《出入境證件拍照指引》提交申請人照片。
2.16周歲以下未辦理居民身份證的，可提交戶口簿。
3、根據監護人的意見決定是否采集指紋。。
4.如申請人年齡在16以下，須由監護人陪同申請。還應當提交出生醫學證明、戶口簿、監護關系公證書、監護人身份證明等能夠直接反映監護關系的監護證明材料。監護人無法陪同的，可以委托他人陪同，陪同人員應當提交本人身份證明、監護人委托書和身份證。
擴展數據:
大陸居民跨省申請往來臺灣省通行證，可就近向居住地公安機關出入境管理機構提出申請。在31城市，符合條件的本地戶籍居民配偶、16周歲以下子女，以及非本地戶籍職工、學生及其配偶、16周歲以下子女，可在居住地附近提交大陸居民往來臺灣通行證及簽註申請。
31城市包括:北京、天津、石家莊、太原、呼和浩特、沈陽、大連、長春、哈爾濱、上海、南京、杭州、寧波、合肥、福州、廈門、南昌、濟南、青島、鄭州、武漢、長沙、廣州、深圳、南寧、海口、重慶、成都。
參考資料:
公安出入境網上服務平臺-註冊居民申請大陸居民往來臺灣通行證
參考資料:
公安出入境網上服務平臺-辦理大陸居民跨省異地往來臺灣通行證