2.海關接受申報。無論采用電子數據報關單還是紙質報關單申報，海關接受申報數據的日期為其接受申報的日期。
3、海關審核電子數據報關單。海關審查電子數據報關單時，需要申報人說明、解釋情況或者提供補充材料的，申報人接到海關通知後應當及時說明或者提供完整材料。
4.申請人提交書面文件。海關已審結電子數據報關單並經審核合格的，申報人應當自收到海關“現場提示”或“放行提示”通知之日起10日內，持打印好的紙質報關單，準備好所需的隨附單證，簽字蓋章後提交貨物所在地海關(提貨)。
5.檢查。需要檢驗的貨物，應當移交檢驗部門進行現場檢驗。申請人應派人協助檢查，並負責移動貨物、打開和重新密封貨物包裝。檢查結束後，簽字確認檢查結果。
6.稅費支付。海關印制並開具應稅貨物完稅憑證，按規定收取免稅貨物和保稅貨物監管費。納稅人在指定銀行繳納(符合條件的可以網上繳納)。
7.發布海關查驗貨物並收取稅費後，辦理單證放行手續，準許出口貨物裝運。如果沒有控制檢查，也沒有稅收，文件核實後放行。
8.通關。指出口貨物的通關監管程序。出口通關是指海關收到出口貨物運輸工具清潔艙單的電子數據，核實出口貨物實際離境。
9、簽發報關員證、核銷。根據外匯、稅務、海關對加工貿易管理的要求，申請人在辦理完海關手續後，可向海關申請簽發以下報關單:用於出口退稅的出口貨物報關單；用於付匯的進口貨物報關單證明；辦理收匯的出口貨物報關單證明；加工貿易核銷海關核銷單。