保稅物流園區實行自由貿易區和出口加工區疊加政策:國內貨物即進入園區視同出口，辦理通關手續，即予退稅；園區內貨物按國內進口貨物的有關規定辦理通關手續，按實際狀態統壹征稅；貨物區域自由流動，免征增值稅和消費稅。
退稅政策:
1，保稅區:區外企業將貨物直接銷售給保稅區企業，出口企業從保稅區退稅後。如果區外企業將貨物出售給國外，而國外貨物在保稅區內臨時倉儲，區外企業待貨物出口並報關後憑離境清單辦理退稅。
保稅物流園區:保稅物流園區的進出口貨物視同離境出口報關可以獲得退稅，但保稅物流園區不辦理加工業務。