壹、聯系
自理報關和代理報關都是針對貨物報關而言，兩者必須依法在海關註冊登記後才能辦理報關業務；
二、區別
1、自理報關單位是經經貿管理部門批準，有進出口經營權的企業。自理報送單位可以對外簽約，並只能向海關辦理本身所簽約項下的進出口貨物的報關手續，不能代辦其他單位簽約的貨物報關手續。
2、代理報關企業是具有有關部門批準的對外；貿易倉儲運輸、國際運輸工具、國際運輸工具服務及代理等業務經營權，兼營報關服務業務的企業。代理報關企業是歷史沿襲而成的，如外運、外代公司等。它只能代理該企業所承攬的貨物的報關業務。
擴展資料：
報關流程
進出口商向海關報關時，需提交以下單證：
1、進出口貨物報關單。壹般進口貨物應填寫壹式二份；需要由海關核銷的貨物，如加工貿易貨物和保稅貨物等，應填寫專用報關單壹式三份；貨物出口後需國內退稅的，應另填壹份退稅專用報關單。
2、貨物發票。要求份數比報關單少壹份，對貨物出口委托國外銷售，結算方式是待貨物銷售後按實銷金額向出口單位結匯的，出口報關時可準予免交。
3、陸運單、空運單和海運進口的提貨單及海運出口的裝貨單。海關在審單和驗貨後，在正本貨運單上簽章放行退還報關貢，憑此提貨或裝運貨物。
4、貨物裝箱單。其份數同發票。但是散裝貨物或單壹品種且包裝內容壹致的件裝貨物可免交。
5、出口收匯核銷單。壹切出口貨物報關時，應交驗外匯管理部門加蓋"監督收匯"章的出口收匯核銷單，並將核銷編號填在每張出口報關單的右上角處。
6、海關認為必要時，還應交驗貿易合同、貨物產地證書等。
參考資料：
百度百科—代理報關