加工貿易手冊核銷是指手冊實施後，需要在海關和外經貿委進行核銷，手冊核銷後才算完全實施。
核銷單的核銷是指出口申報結匯後，在出口收匯核銷網上申報系統或直接在國家外匯管理局核銷高級核銷單，並在核銷完畢後執行核銷單。