外匯不能收運費。

(1)樓上的我不太贊同。甚至外貿公司都可以用美元和貨代結算，比如做CIF時需要支付給貨代(貨代，船公司)的運費。但是從財務會計的角度來說，收款人應該和開票人是壹樣的。

(2)關於結匯，需要的資料是工廠開具的增值稅發票，銀行開具的收匯憑證，核銷單，報關單。因此，這與妳想用哪種貨幣支付費用無關。

妳這個問題聽起來很難，妳要和財務部門溝通清楚。如有必要，咨詢官方機構。