星野鐵郎：未來的地球上，少數未做機械化身體的完全人類。夢想是到可以免費換機械身體的鐵道999號終站。
梅德爾（或梅蒂爾）：機械伯爵的養女。不知為何有兩張無限期的999號列車車票，不知其為人類否。在冥王星可能有壹段傷心的過去。
機械伯爵：在地球上，以狩獵之名殺害鐵郎母親並將她制成標本的機械化身體人類。後被鐵郎擊殺。
車長：999號列車的乘務人員，性格認真，他的過去就像他的身體壹樣是個迷。
足立：在明日之星因二人車票被偷兒租的臨時公寓，他們唯壹的室友。外表上與鐵郎年紀相仿，很有想法，不氣餒的年輕人。在食用鐵郎臨別前送的泡面時發現超特急999號列車。但被大嬸（公寓管理員）笑談為年輕人的夢話。
木森豐：在枯葉之環遇見的機械化人類。身體以榕樹構成。職業是畫家。喪於同化了999號列車車頭能量的電蘑菇之下。
世井正雪：逃亡至陽炎星的作家，三十年未與其它人類接觸，正向宇宙最長的胡子、頭發及小說挑戰。遇見鐵郎跟梅德爾時，正邁向第13億128萬9668張四百字的稿紙。爾後其見到梅德爾的美貌而想逃離這個世界，將鐵郎電暈後即與梅德爾搭乘999號列車離開；但因其年事已高而無法乘車才又與梅德爾回到陽炎星。看到了梅德爾的真面目後就打消回到人類世界的念頭？！
變形蟲壹家：實際名字不詳。其子女在不定形行星奴魯巴上拓印了鐵郎及梅德爾的樣子，連車長都分辨不出。最後變形蟲父親出面和解，且其似乎知道梅德爾的真實身份……
蕾蘭：暗闇星的居民之壹，是米露的姐姐。誌向是將暗闇星改造成為充滿光明的星球，因而被自己的母親與妹妹委托鐵郎殺掉自己。挾持梅德爾之後，成功發射人工太陽，卻無法接受自己的妹妹長的與自己壹樣；妹妹殺了蕾蘭以後便在後者的居所外自殺。
柳芝：與梅德爾相識，能自由控制時間流轉速度的人物。999號列車是其第20輛弄翻的列車。
史巴利：裝甲行星上的醫生，不是機械人類卻有裝甲般的身體。
奴大盧：史巴利之子。認為鐵郎為入侵者而產生小摩擦。