1.第壹版：1996年啟用。《出生醫學證明》在紫外燈照射下顯示的“中國婦幼衛生”圓形標誌右上方沒有“五角星”標誌。
2.第二版：1999年啟用。增加防偽功能，在“中國婦幼衛生”圓形標誌右上方增加了壹顆無色熒光“五角星”防偽標誌，在紫外燈照射下顯示。同時對第壹版《出生醫學證明》的個別文字進行了修改，將《出生醫學證明》下方的“出生證編號”，相應地將其英文翻譯由“Birth NO.”改為“Birth certificate NO.”；《出生醫學證明》右方英文版說明“china”中的小寫“c”改為大寫“C”。
3.第三版：2003年啟用。《出生醫學證明》由兩聯增加為三聯，增加的壹聯為接生單位存根。在原防偽印制技術基礎上，采用專用圖案水印，水印圖形為齒輪中央環五角星。中國版圖及環形圖案內隱含“中國婦幼衛生標誌”及“五角星”圖案，在紫外線燈照射下顯示。
2004年12月1日起，在《出生醫學證明》副頁和存根聯“出生證編號”處增印了電子水印防偽條碼。將檢測板平壓於該防偽水印條碼上，當檢測板於0角度時，防偽水印條顯現“出生證”字樣；檢測板逆時針轉動60度，防偽水印條顯現“人口登記”字樣；檢測板逆時針轉動120度，防偽水印條顯現“CSYXZM”字樣（即《出生醫學證明》的拼音字頭）。
二、出生醫學證明編號說明
1.《出生醫學證明》以省、自治區、直轄市為單位統壹地區編號，福建省編號以“35”開頭。
2.2000年起，《出生醫學證明》的《居民身份證》號碼由15位增加到18位。
3.2000年起，《出生醫學證明》編號前按順序增加壹個英文字母，如2000年起編號前加“A”，2001年加“B”，依次類推。