l，深圳模式。這種模式的特點是在資金和證券賬號管理上采用了券商和投資者兩級賬戶體系——只接受場內交易的平倉指令，只接受無支付的交割指令。資金的實際結算T+1發生在交易所，證券公司以交易所為交易對手，通過風險轉移的方式進行凈額結算。證券T+1實際結算在註冊公司。凈結算以交易所的結算指令為基礎。在證券登記方面，深圳采用券商和投資者兩級賬戶制。證券公司管理投資者的二級證券賬戶。每個登記機構同時管理證券公司的壹級證券賬戶和投資者的二級賬戶。資金和證券交割完全分離是深圳模式的最大特點，也是最具爭議的特點。
2.上海模式。這種模式的特點是證券登記過戶采用壹級賬戶制，由上交所全資擁有的中央結算公司直接管理投資者的證券賬戶，而證券商不對投資者負責，證券在T+0逐筆成對結算。資金結算采用二級賬戶制，證券公司資金賬戶T+1在上海中央結算公司、各委托機構和銀行之間進行凈額結算。證券公司的壹級資金賬戶由上海中央結算公司、各委托機構和銀行管理，投資者的二級資金賬戶由證券公司管理。證券和資金的交付不同步是上海模式的最大特點。
3.NET和sTAQ模式(法國持股模式)。這種模式的特點是，在資金結算上，和深圳模式壹樣，采用二級賬戶和凈額結算。證券清算也是二級系統，但投資者二級賬戶由券商直接管理，接近香港模式。
這三種模式各有利弊，但都有壹定的特點，這就是我國證券清算登記制度的特點。
1，我國證券清算登記系統起點高，發行、轉讓、清算已全國無紙化；計算機網絡、衛星傳輸等高新技術在清算登記工作中得到廣泛應用。在短短的幾年時間裏，我們走過了西方國家幾十年甚至上百年走過的路，在某些方面還處於領先地位。
2.由於高科技的應用，我國的證券清算、轉賬、資金結算可以在T+1完成，有的可以在T+0完成。投資者、交易所和證券公司的結算風險大大降低。因此形成了高效率、低風險的鮮明特點。
雖然我國在證券清算登記制度建設方面取得了如此驚人的成就，但我們也應該清醒地看到其不足之處。
(1)“兩所兩網”相互獨立，市場參與者都是壹樣的。壹般券商會同時擁有“兩交兩網”的交易席位，但交易清算機制相互獨立。因此，增加了券商的成本負擔和資金周轉風險，不利於券商和投資者在各個市場的流動，最終將限制全國市場的整體發展。
(2)清算登記制度僅限於為場內交易提供服務，忽視跨市場、跨區域、跨域結算業務的發展，過於依賴場內交易，使得清算登記制度的發展處於被動地位。
(3)清算登記系統只服務於成員機構，不關註個人客戶業務的發展。投資者往往依賴於證券公司，這大大降低了清算登記制度的效率。
(4)資金結算依托銀行系統，尤其是人民銀行電子聯行系統。因此，銀行體系的效率直接影響證券市場的資金結算效率，而未來銀行體系的改革也將直接影響證券市場資金結算機制的前景。目前，人民銀行上海分行每天進行兩次票據交易，這對上交所開展國債期貨交易非常有利，而深圳人民銀行每天只進行壹次票據交易，這大大增加了深交所開展國債期貨交易的風險。
(5)立法滯後。清算登記機構在法律上沒有被賦予應有的法律地位，清算登記各方的法律責任也沒有明確規定。如果結算失敗，遭受損失的往往是投資者。
(6)各類清算系統普遍存在風險意識薄弱的問題。沒有補償機制，平倉保證金流於形式，無法防止券商惡性透支造成的損失。同時，清算機制並沒有為投資者提供擔保機制。
為此，我們應該積極研究和借鑒外國的成功經驗，制定我們的發展方向和目標。