內部組織機構上，永安有配置完整的專業研發機構、市場業務部門、異地營業部、辦事處及職能支持部門五種型態。專業研發機構有期貨研究中心、金融工程總部及北京研究院等3個部門；市場業務部門設有市場營銷總部、產業發展總部、國際業務總部等3個壹級部門，及機構業務壹部、業務壹部、業務二部、業務三部等4個二級部門；異地營業部已開業的25家，分別設在北京、上海、沈陽、石家莊、濟南、青島、長沙、福州、無錫、南昌、鞍山、溫州、寧波、紹興、臺州、嘉興、義烏、金華、余姚、蕭山、瑞安、淄博、長春、重慶、濰坊等地；職能支持部門有金融事業總部、交易運作總部、計劃財務總部、綜合管理總部、機構管理總部、稽核督查總部等6個部門；此外，在上海、大連、鄭州等地設有3個辦事機構。
公司治理結構規範，股權比例合理。永安設有規範的股東會、董事會、監事會、獨立董事、首席風險官，分別有相互制衡的制度及議事規則。股東由財通證券經紀有限公司、浙江省經濟建設投資公司、浙江協作大廈有限公司、浙江國際貿易集團有限公司、浙江東方集團股份有限公司(股東資格報批中)、浙江瑞和、浙江德邦等7家單位組成，其中上市公司浙江東方擁有的公司股權於2009年12月以公開競拍方式獲得。國有股東、上市公司的股權比例94.57%，民營企業股權比例5.43%。
公司業務平臺完整，具有期現結合和跨境服務能力。永安參股設立的浙江中邦實業有限公司，主要從事期貨市場上市品種的現貨貿易。永安還是國內首批經國務院批準在港設立分支機構的三家試點期貨公司之壹，在香港設有我方控股的、與新鴻基集團合作的中國新永安期貨有限公司，主要從事期貨交易和咨詢，及香港本地和香港證監會（SFC）認可的境外商品、金融期貨經紀業務。中國新永安作為首批內地公司境外開放的試點之壹，成立至今在同類企業中壹直處於經營領先地位。