缺貨成本能否作為決策的相關成本，取決於企業是否允許庫存短缺的不同情況。如果允許缺貨，缺貨成本與庫存數量成反比，即屬於決策相關成本；另壹方面，如果企業不允許缺貨情況，此時缺貨成本為零，則不需要考慮。
缺貨成本的簡單計算；
很多企業會考慮保持壹定的安全庫存或緩沖庫存，以防止需求的不確定性，但安全庫存的存在自然會導致壹定的庫存成本，同時需要註意的是，安全庫存每增加壹個增量都會降低效益。超過預期需求的第壹個單位的保險庫存對短缺提供了最大的預防作用，而第二個單位提供的預防作用略小於第壹個單位，以此類推。在保持壹定的保險庫存水平時，儲存額外庫存的成本加上預期缺貨成本會有壹個最小值，這就是最大水平。如果高於或低於這個最優水平，就會出現凈虧損。
為了確定必要的庫存，有必要確定短缺造成的損失。
第壹步，分析缺貨可能造成的後果，包括延期交貨、銷售損失、客戶流失。
第二步，計算與可能結果相關的成本，即利潤損失。
第三步是計算短缺的成本。
如果出現內部短缺，可能會導致生產損失(機器、設備和人員閑置)和交貨延遲。如果因為壹個物品的缺貨而導致整條生產線停工，那麽缺貨成本可能會非常高，特別是對於按時生產的企業。為了對保險庫存做出最佳決策，制造企業應該對原材料短缺造成的成本有壹個全面的了解。首先確定每小時或每天的生產率，然後計算停工造成的減產，最後得到利潤的損失。