上海證券交易所成立於1990年12月；
深圳證券交易所成立於1991年7月。
2、上市條件不同。
上海證券交易所和深圳證券交易所的上市條件和適用類型不同，上海證券交易所比較適合於大型、業績穩定的公司，而深圳證券交易所適合中小型、正在發展中的公司。
3、職責不同。
上海證券交易所的主要職能有：處理相應的上市申請，安排各類證券上市；組織、監督證券的交易；對會員、上市公司進行監管；管理和發布市場的信息。
深圳證券交易所的主要職能包括：處理應對上市申請、安排證券上市：組織、監督證券的交易；監管工作；管理和公布市場的信息；還有通過中國證監會許可的其他職能。
4、股票代碼
上海交易證券所股票代碼以6開頭，股票板塊都是主板。而深圳證券交易所則不同在詳細的分類，其股票代碼可以分為三大板塊即主板（000，001），中小板（002），創業板（300）。因此通過不同的股票代碼數字，是最為簡單區別兩大證券交易所的方法之壹。
5、開戶方式
上海交易所在開通賬戶後就可以進行所有有關上海證券交易所上市的股票，而深圳證券交易所則會針對創業板塊進行單獨的條件設立，即符合條件才能開戶。
6、過戶費
雖然過戶費金額相對於資本市場的大額資金變動來說不值壹提，但是深交所對於上交所的壹個優勢在於，深交所不需要繳納過戶費用，而上交所需要用戶提交壹元的過戶費。
7、經營範圍
上海交易所經營範圍主攻證券集中交易的場所和設施，組織管理上市證券的交易活動，提供和管理該所的證券市場信息以及和國家證券主管機關批準的相關業務等。
深圳證券交易所則提供買賣有價證券的現貨和期貨，也會提供各類證券交易，這其中就包括產權股權轉讓、期貨、大額存款證等交易的相關業務等。