申請小額信用貸款時，農民應首先向當地農村信用社申請貸款證明。農村信用社收到申請後，將對申請人的信用等級進行評估，並根據評估後的信用等級，核實相應級別的信用貸款限額，並出具貸款證明。當農民需要小額信用貸款時，他們可以憑貸款證明和有效身份證件直接向農村信用社申請。農村信用社收到貸款申請時，應審查貸款用途和金額，審查合格後發放貸款。
需要註意的是，根據現行規定，只能貸款用於種植業和養殖業等農業生產支出；農機貸款；只有將重點放在農業產前、產中、產後服務貸款以及購買日用品、建造房屋、治療疾病和送孩子上學等消費貸款上，農民才能使用小額信用貸款。