目前公積金貸款采用住房置業擔保公司對住房公積金個人購房貸款予以保證的擔保方式,所以需要支付擔保費。
公積金擔保費是壹次性收取的,壹般是首月還款時把擔保費和首月還款額壹並存入貸款人的還款賬戶中進行扣除的。
公積金貸款的擔保費是根據貸款金額和年限綜合計算的。按照正常流程，銀行只有在出示抵押證明時才能發放房屋貸款，而貸款證明則需要房屋過戶、兩證辦理齊全後才能出具，這樣不但貸款手續繁瑣，而且也會令賣方而面臨的壹個房、財可能兩空的尷尬局面，為避免這種情況出現，房貸擔保費就應運而生了。
壹般按揭貸款就兩項費用（包括商貸、公積金、組合）：壹是抵押登記費，用於在房產局辦理抵押登記，由銀行代收。這個是必須交的。二是房屋保險費，收費標準：貸款金額；貸款年限。這個是自願的，銀行壹般不會強制收取。
個人住房貸款擔保費計算：保費標準為：年初貸款本息余額年擔保費率1％。擔保費在簽訂借款合同時壹次性收取。房貸擔保費只要有經濟組織的擔保證明，這時所支付的費用就是房貸擔保費。