設立民辦教育發展專項資金，部分常委會組成人員和省人大教科文衛委員會審議認為，縣級以上人民政府都應當設立民辦教育發展專項資金，並規定其用途及管理辦法。對此，壹審修改稿規定，縣級以上人民政府應當將民辦教育納入整個教育事業統籌安排，設立民辦教育發展專項資金，用於資助民辦學校發展，表彰和獎勵有突出貢獻的集體、個人。
對於民辦學校建校征用土地的土地使用權，壹審修改稿規定，民辦學校願意以出讓方式依法取得土地使用權的，縣級以上人民政府可以優先將土地使用權出讓給民辦學校。民辦學校以劃撥方式或者出讓方式取得土地使用權，出資人不要求取得合理回報的，享受與公辦學校同等的稅費待遇。
享受五種優惠政策
壹審修改稿規定，民辦學校依法享受國家規定的稅收優惠政策和同級同類公辦學校基本建設的優惠政策，依法享受以下五種國家規定的優惠政策：對從事學歷教育的學校提供教育勞務取得的收入，免征營業稅；對學校從事技術開發、技術轉讓和與之相關的技術咨詢、技術服務業務取得的收入，免征營業稅；對學校取得的財政撥款，從主管部門和上級單位取得的用於事業發展的專項補助收入，不征收企業所得稅；對托兒所、幼兒園提供養育服務取得的收入，免征營業稅；其他稅收優惠政策。
鼓勵企業為民辦學校貸款擔保壹審修改稿規定，民辦學校可以以教育設施以外的財產作抵押，向金融機構申請貸款；但不得以劃撥方式取得的土地使用權抵押貸款。鼓勵金融機構對民辦學校實行信用貸款，鼓勵國有資產經營公司、國有投資公司以及其他企業和社會財團為民辦學校提供貸款擔保。壹審修改稿還規定，民辦學校舉辦者應當與教職工簽訂聘用合同或者勞動合同，並按照同級同類公辦學校教職工的標準，為學校教職工繳納社會保險費。