法律分析：由公司承擔還款責任，股東可以追償。在所有股東不知情的情況下，公司法人代表以公司名義向個人借款，由於公司法定代表人的行為代表公司 ，因此，這種情況應當由公司承擔還款責任。 法定代表人的行為未經股東會議通過，公司償還借款後，股東可以向法定代表人追償。
法律依據：《中華人民***和國公司法》
第三條 公司是企業法人，有獨立的法人財產，享有法人財產權。公司以其全部財產對公司的債務承擔責任。有限責任公司的股東以其認繳的出資額為限對公司承擔責任；股份有限公司的股東以其認購的股份為限對公司承擔責任。
第二十條 公司股東應當遵守法律、行政法規和公司章程，依法行使股東權利，不得濫用股東權利損害公司或者其他股東的利益；不得濫用公司法人獨立地位和股東有限責任損害公司債權人的利益。公司股東濫用股東權利給公司或者其他股東造成損失的，應當依法承擔賠償責任。公司股東濫用公司法人獨立地位和股東有限責任，逃避債務，嚴重損害公司債權人利益的，應當對公司債務承擔連帶責任。