1、貸款利率不同，公積金貸款相比於商業貸款利率要便宜壹些，也是很多人選擇公積金貸款的原因之壹；
2、放款人不同，公積金貸款是委托指定的銀行辦理，最終是由公積金管理中心放款的，商業貸款由商業銀行放款；
3、風險承擔主體不同，公積金貸款的風險承擔主體是公積金管理中心，而商業貸款的風險承擔主體是自己；
4、貸款審批速度不同，公積金貸款除了銀行辦理之外，還需要經過公積金管理中心審批，而商業銀行只需銀行進行審批即可，二者相比商業貸款的審批速度要快壹些。
法律依據：《住房公積金管理條例》第二十四條
職工有下列情形之壹的，可以提取職工住房公積金賬戶內的存儲余額：
（壹）購買、建造、翻建、大修自住住房的；
（二）離休、退休的；
（三）完全喪失勞動能力，並與單位終止勞動關系的；
（四）出境定居的；
（五）償還購房貸款本息的；
（六）房租超出家庭工資收入的規定比例的。
依照前款第（二）、（三）、（四）項規定，提取職工住房公積金的，應當同時註銷職工住房公積金賬戶。
職工死亡或者被宣告死亡的，職工的繼承人、受遺贈人可以提取職工住房公積金賬戶內的存儲余額；無繼承人也無受遺贈人的，職工住房公積金賬戶內的存儲余額納入住房公積金的增值收益。