1、入學難度不同
學術型碩士的全國碩士研究生入學統壹考試（統考）完全是嚴進寬出的代表。據了解，壹些名校熱門專業的錄取比例甚至為70：1。而壹些二流學校的冷門專業卻年年招不滿。因此，入學難度取決於考生報考的學校和專業。
2、學習方式不同
學術型碩士： 全日制學習。壹般為3年。專業碩士：脫產全日制學習，學制2-3年
3、學習費用不同
學術型碩士錄取為國家計劃內（非定向、定向）的碩士生。從2014年秋季學期起，所有的研究生開始自費。專業碩士從2010年開始基本跟全日制學術型碩士壹樣，錄取為國家計劃內（非定向、定向）的碩士生按國家規定享受免學費待遇。
錄取為國家計劃外（委托培養、自籌經費）的碩士生須繳納學費，壹般為8000元/年，不同專業有所不同。對於自籌經費生、特困生等考生可通過申請國家助學貸款或者商業貸款緩解學費的壓力。
4、文憑頒發不同
學術型碩士同時頒發學位和學歷證書。專業碩士10月份單獨考試頒發學位證書，1月份考試同時頒發學位和學歷證書。
5、社會認可度不同
學術型碩士：由於是全日制正規大學碩士畢業，擁有學歷、學位雙證，因此社會對這樣的畢業生的認可度非常高。但企業在招聘時也會考慮到全日制碩士研究生的弱點：光有理論，經驗不足。特別對於碩士專業與本科專業方向完全不同，又從無相關工作經驗的求職者，企業會有所顧忌。
百度百科-專業型碩士
百度百科-學術型碩士