公積金貸款和商業貸款主要有三個區別。
1.貸款利率:目前公積金五年期以上貸款利率為3.25%（年），商業貸款利率為4.9%（年）。
2.貸款額度和期限:壹般來說，普通購房者申請商業貸款時，除了自身收入會影響貸款額度外，商業銀行的住房貸款額度上限是足夠的，而公積金則受繳納人群和地區的特點限制。
3.還款方式:商業銀行可以選擇的方式有很多，但公積金貸款的方式相對簡單。